Med nettopp nautilusmetoden er det dette som er målet med treningen. Kort forklart er nautilusmetoden ett fullkroppsprogram som trenes 2-3 ganger i uka, der man velger ut 7-12 øvelser på de største muskelgruppene i kroppen. Hver øvelse gjennomføres kun én gang, der man optimalt skal gjennomføre hver øvelse med 8-12 repetisjoner per sett. Med andre ord vil det si at man løfter 75% av 1 RM (én repetisjon maksimum). Dersom man klarer maksimalt 20 kg (1 RM), skal det da løftes cirka 15 kg 8-12 ganger, til utmattelse i muskelen(e). Hvert sett skal kjøres til man ikke orker mer og det er ingen pause mellom hver øvelse, sett bort ifra tiden det tar å gå fra maskin til maskin.
Teorien er utviklet for å isolere musklene, derfor er det lagt vekt på at man skal gjennomføre dette på maskiner og ikke bruke frie vekter og stenger, der man fortere kan skade seg. Maskinene skal være konstruert slik at i de partier av bevegelsen hvor muskelen er sterk, får man mye motstand, og der den er svak blir motstanden mindre. (Viktig å huske på at dette ikke alltid stemmer.)
For det første er metoden tidseffektiv. Det som tar tid med denne treningen er første økt hvor man skal finne maskinene man ønsker å bruke for å trene ulike muskelgrupper. I tillegg skal man finne ut hvor mye vekter man skal ha på for å oppnå utmattelse etter 8-12 repetisjoner. Når treningen er i gang går det derimot veldig raskt i og med at det ikke er pause mellom hver øvelse. Derfor er det ikke sikkert at selve treningen tar mer enn 10 minutter. I tillegg er det litt oppvarming i starten og nedtrapping til slutt, men dette gjelder også for normal styrketrening.
Nautilusmetoden er sikker og sjansen for å skade seg er mindre. Apparatet jobber i muskelens naturlige bane og fordeler belastningen likt gjennom hele bevegelsen. I tillegg har man god støtte i rygg og andre partier der skadene fort kan oppstå. Som regel har man også med seg en personlig trener, instruktør eller medhjelper som hjelper til med å stille inn maskinene og se at øvelsene blir korrekt gjennomført.
I tillegg til dette gir også metoden resultater raskt. Dersom du trener regelmessig, har et sunt kosthold og lar kroppen hente seg inn mellom øktene, vil du oppleve gode resultater. På bare 1–3 måneder kan du gjøre om 3–5 kilo fett til 0,5–2,0 kilo muskler. Med intensiv trening kan du doble styrken din på seks måneder. (Husk at muskler veier mer enn fett.)